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Article

1 - ÉQUATION DE SCHRÖDINGER DANS LE CAS D’UNE MOLÉCULE

2 - MÉTHODES AB INITIO BASÉES SUR LA DÉTERMINATION DE LA FONCTION D’ONDE

3 - BASES DE FONCTIONS ATOMIQUES UTILISÉES

4 - MÉTHODES SEMI-EMPIRIQUES ET EMPIRIQUES

5 - THÉORIE DE LA FONCTIONNELLE DE LA DENSITÉ (DFT, DENSITY FUNCTIONAL THEORY)

  • 5.1 - Bases modernes de la DFT
  • 5.2 - Équations de Kohn-Sham (KS)
  • 5.3 - Trois générations de fonctionnelles
  • 5.4 - Théorie de la fonctionnelle de la densité dépendante du temps (TD-DFT)

6 - SOLVATATION, CALCULS QM/MM ET DYNAMIQUE MOLÉCULAIRE

  • 6.1 - Solvatation
  • 6.2 - Calculs QM/MM
  • 6.3 - Dynamique moléculaire (DM)

7 - CALCUL DE PROPRIÉTÉS

8 - LOGICIELS ACTUELS

9 - CONCLUSION

Article de référence | Réf : AF6050 v2

Méthodes semi-empiriques et empiriques
Méthodes de la chimie quantique

Auteur(s) : Ghania BOUCEKKINE, Abdou BOUCEKKINE

Date de publication : 10 janv. 2017

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RÉSUMÉ

Il est à présent possible d’évaluer avec une bonne précision par le calcul quantique différentes propriétés moléculaires et de simuler des processus réactionnels complexes. On présente différentes méthodes de résolution de l’équation de Schrödinger, celles basées sur la théorie de Hartree-Fock ainsi que les toutes dernières techniques qui permettent d’atteindre des solutions précises de l’équation. Celles basées sur la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) et la DFT dépendante du temps (TD-DFT) sont parmi les principaux outils de la chimie computationnelle actuelle. Des aspects techniques sont également abordés telles que les bases d’orbitales atomiques à utiliser, la solvatation, les méthodes mixtes mécanique quantique-mécanique moléculaire (QM/MM), la dynamique moléculaire.

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Auteur(s)

  • Ghania BOUCEKKINE : Docteur es-sciences

  • Abdou BOUCEKKINE : Professeur émérite Institut des sciences chimiques de Rennes, UMR 6226 CNRS Université de Rennes 1, Rennes, France

INTRODUCTION

Le développement sans cesse croissant de la technologie des ordinateurs a permis l’essor des méthodes de simulation numérique et de modélisation dans tous les domaines, allant de l’économie, à la météorologie, la biochimie et la physique nucléaire. Dans ce contexte, et pour ce qui concerne les propriétés physico-chimiques de la matière, les méthodes de la chimie quantique permettent, par le calcul, d’étudier un grand nombre de propriétés moléculaires, et, en particulier, de simuler des réactions chimiques voire même des processus biochimiques. Ainsi, on peut accéder actuellement par le calcul, pour tout système moléculaire :

  • à des grandeurs énergétiques : l’énergie totale, l’énergie d’ionisation, l’affinité électronique ;

  • à des grandeurs géométriques : longueurs et angles de liaison, conformations ;

  • aux propriétés spectroscopiques : spectres ultraviolet-visible, infrarouge et micro-onde, spectres de luminescence ;

  • aux propriétés électriques : moments dipolaires, multipolaires, les polarisabilités et hyperpolarisabilités ;

  • aux propriétés magnétiques : déplacements chimiques et constantes de couplage de RMN, susceptibilités et couplages magnétiques, tenseurs g et A de résonance paramagnétique électronique (RPE).

Dans le présent article, on expose différentes méthodes de résolution de l’équation de Schrödinger, celles basées sur la théorie de Hartree-Fock (HF) ainsi que les techniques corrélées dites post-HF qui permettent d’atteindre des solutions précises de l’équation, et aussi celles basées sur la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) et la DFT dépendante du temps (TD-DFT) qui sont parmi les principaux outils de la chimie computationnelle actuelle. Des aspects techniques sont également abordés telles que les bases d’orbitales atomiques à utiliser, la solvatation, les méthodes mixtes mécanique quantique-mécanique moléculaire (QM/MM), la dynamique moléculaire. Un exemple détaillé de calcul d’orbitales moléculaires est également présenté.

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VERSIONS

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DOI (Digital Object Identifier)

https://doi.org/10.51257/a-v2-af6050


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4. Méthodes semi-empiriques et empiriques

Lors de la résolution des équations HF-Roothaan, une des étapes les plus longues est le calcul des intégrales biélectroniques (rs|pq) entrant dans l’expression des éléments matriciels de la matrice de Fock F définis par la relation (24). Si n est la dimension de la base, le nombre d’intégrales biélectroniques s’élève à n 4 ce qui limite la taille des molécules étudiées. À une époque où les moyens informatiques de calcul étaient très limités, les quantochimistes essayèrent d’imaginer une simplification de ces calculs, laquelle permettrait de traiter tout système moléculaire sans restriction de taille. L’introduction d’approximations, dans les équations de HF-Roothaan, a donné naissance aux méthodes dites semi-empiriques. Actuellement, du fait de la puissance des ordinateurs sans cesse croissante, l’utilisation de ces méthodes se raréfient sauf pour des systèmes moléculaires de très grande dimension.

Il existe deux sortes de méthodes semi-empiriques :

  • celles dans lesquelles l’Hamiltonien du système est considéré comme une somme d’hamiltoniens monoélectroniques effectifs (efficaces) non explicités telles que la méthode de Hückel étendue (Extended Hückel Theory – EHT) ;

  • celles dérivant des équations de HF-Roothaan.

4.1 Méthode de Hückel étendue (EHT)

Cette méthode mise au point par R. Hoffman  ...

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BIBLIOGRAPHIE

  • (1) - HÜCKEL (E.) -   Quantentheoretische Beitrage zum Benzolproblem.  -  Z. Phys., 70, p. 204-286 (1931).

  • (2) - SCHRÖDINGER (E.) -   The non relativistic equation of the De Broglie waves.  -  Ann. Physik, 79, p. 361-376 (1926).

  • (3) - BORN (M.), OPPENHEIMER (R.) -   Zur Quantentheorie der Molekeln.  -  Ann. Physik, 84, p. 457-484 (1927).

  • (4) - HARTREE (D.R.) -   The wave mechanics of an atom with a non-coulomb central field. Part I. Theory and methods.  -  Proc. Cambridge Phil. Soc., 24, p. 89-132 (1928).

  • (5) - FOCK (V.) -   Näherungsmethoden zur Lösung des Quantenmechanischen Mehrkörperproblems.  -  Zeit. Physik, 61, p. 126-148 (1930).

  • (6) - SLATER (J.C.) -   The theory of complex spectra.  -  Phys. Rev., 34, p. 1293-1322 (1929).

  • ...

1 Sites Internet

Base de données de fonctions gaussiennes à l’usage de la chimie quantique http://bse.pnl.gov/bse/portal

Logiciel Molden http://www.cmbi.ru.nl/molden

Logiciel Molekel https://www.chemeurope.com/en/encyclopedia/Molekel.html

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