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Article

1 - ÉQUATION DE SCHRÖDINGER DANS LE CAS D’UNE MOLÉCULE

2 - MÉTHODES AB INITIO BASÉES SUR LA DÉTERMINATION DE LA FONCTION D’ONDE

3 - BASES DE FONCTIONS ATOMIQUES UTILISÉES

4 - MÉTHODES SEMI-EMPIRIQUES ET EMPIRIQUES

5 - THÉORIE DE LA FONCTIONNELLE DE LA DENSITÉ (DFT, DENSITY FUNCTIONAL THEORY)

  • 5.1 - Bases modernes de la DFT
  • 5.2 - Équations de Kohn-Sham (KS)
  • 5.3 - Trois générations de fonctionnelles
  • 5.4 - Théorie de la fonctionnelle de la densité dépendante du temps (TD-DFT)

6 - SOLVATATION, CALCULS QM/MM ET DYNAMIQUE MOLÉCULAIRE

  • 6.1 - Solvatation
  • 6.2 - Calculs QM/MM
  • 6.3 - Dynamique moléculaire (DM)

7 - CALCUL DE PROPRIÉTÉS

8 - LOGICIELS ACTUELS

9 - CONCLUSION

Article de référence | Réf : AF6050 v2

Calcul de propriétés
Méthodes de la chimie quantique

Auteur(s) : Ghania BOUCEKKINE, Abdou BOUCEKKINE

Date de publication : 10 janv. 2017

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RÉSUMÉ

Il est à présent possible d’évaluer avec une bonne précision par le calcul quantique différentes propriétés moléculaires et de simuler des processus réactionnels complexes. On présente différentes méthodes de résolution de l’équation de Schrödinger, celles basées sur la théorie de Hartree-Fock ainsi que les toutes dernières techniques qui permettent d’atteindre des solutions précises de l’équation. Celles basées sur la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) et la DFT dépendante du temps (TD-DFT) sont parmi les principaux outils de la chimie computationnelle actuelle. Des aspects techniques sont également abordés telles que les bases d’orbitales atomiques à utiliser, la solvatation, les méthodes mixtes mécanique quantique-mécanique moléculaire (QM/MM), la dynamique moléculaire.

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Auteur(s)

  • Ghania BOUCEKKINE : Docteur es-sciences

  • Abdou BOUCEKKINE : Professeur émérite Institut des sciences chimiques de Rennes, UMR 6226 CNRS Université de Rennes 1, Rennes, France

INTRODUCTION

Le développement sans cesse croissant de la technologie des ordinateurs a permis l’essor des méthodes de simulation numérique et de modélisation dans tous les domaines, allant de l’économie, à la météorologie, la biochimie et la physique nucléaire. Dans ce contexte, et pour ce qui concerne les propriétés physico-chimiques de la matière, les méthodes de la chimie quantique permettent, par le calcul, d’étudier un grand nombre de propriétés moléculaires, et, en particulier, de simuler des réactions chimiques voire même des processus biochimiques. Ainsi, on peut accéder actuellement par le calcul, pour tout système moléculaire :

  • à des grandeurs énergétiques : l’énergie totale, l’énergie d’ionisation, l’affinité électronique ;

  • à des grandeurs géométriques : longueurs et angles de liaison, conformations ;

  • aux propriétés spectroscopiques : spectres ultraviolet-visible, infrarouge et micro-onde, spectres de luminescence ;

  • aux propriétés électriques : moments dipolaires, multipolaires, les polarisabilités et hyperpolarisabilités ;

  • aux propriétés magnétiques : déplacements chimiques et constantes de couplage de RMN, susceptibilités et couplages magnétiques, tenseurs g et A de résonance paramagnétique électronique (RPE).

Dans le présent article, on expose différentes méthodes de résolution de l’équation de Schrödinger, celles basées sur la théorie de Hartree-Fock (HF) ainsi que les techniques corrélées dites post-HF qui permettent d’atteindre des solutions précises de l’équation, et aussi celles basées sur la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) et la DFT dépendante du temps (TD-DFT) qui sont parmi les principaux outils de la chimie computationnelle actuelle. Des aspects techniques sont également abordés telles que les bases d’orbitales atomiques à utiliser, la solvatation, les méthodes mixtes mécanique quantique-mécanique moléculaire (QM/MM), la dynamique moléculaire. Un exemple détaillé de calcul d’orbitales moléculaires est également présenté.

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VERSIONS

Il existe d'autres versions de cet article :

DOI (Digital Object Identifier)

https://doi.org/10.51257/a-v2-af6050


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7. Calcul de propriétés

7.1 Grandeurs géométriques

La prise en compte de la corrélation électronique est nécessaire pour déterminer longueurs et angles de liaison, et conformations moléculaires avec une bonne précision. Signalons que l’on peut montrer que la théorie de Hartree-Fock sous-estime systématiquement les longueurs de liaison, lorsque les calculs sont poussés jusqu’à la limite de Hartree-Fock (base complète d’orbitales atomiques). Actuellement, la mise en œuvre de calculs DFT avec une fonctionnelle bien choisie telle que B3LYP et une base d’orbitales atomiques suffisamment étendue (par exemple, de type triple zéta plus polarisation) permet généralement de calculer des structures géométriques avec une précision équivalente à celle de la diffraction des rayons X, notamment pour les molécules organiques. D’autres fonctionnelles hybrides (PBE0, B3PW91,…) ou meta-GGA (M06-2X, par exemple) sont également performantes dans ce domaine . On peut dire dans ce cas que la simulation numérique pourrait avantageusement remplacer l’expérimentation surtout lorsque cette dernière ne peut être effectuée (cas de molécules rares, toxiques…).

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7.2 Grandeurs énergétiques

Les effets de corrélation sont très importants dans les processus d’ionisation ou de capture d’électrons car le nombre d’électrons varie. De ce fait, la méthode de Hartree-Fock, qui ne prend pas en compte la corrélation est en défaut, aussi bien pour les calculs d’énergies de dissociation que pour l’énergie d’ionisation. Néanmoins, pour cette dernière grandeur, la compensation d’erreur entre la non-prise en compte de la relaxation électronique dans le cation et la corrélation électronique conduit à une bonne estimation des énergies...

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BIBLIOGRAPHIE

  • (1) - HÜCKEL (E.) -   Quantentheoretische Beitrage zum Benzolproblem.  -  Z. Phys., 70, p. 204-286 (1931).

  • (2) - SCHRÖDINGER (E.) -   The non relativistic equation of the De Broglie waves.  -  Ann. Physik, 79, p. 361-376 (1926).

  • (3) - BORN (M.), OPPENHEIMER (R.) -   Zur Quantentheorie der Molekeln.  -  Ann. Physik, 84, p. 457-484 (1927).

  • (4) - HARTREE (D.R.) -   The wave mechanics of an atom with a non-coulomb central field. Part I. Theory and methods.  -  Proc. Cambridge Phil. Soc., 24, p. 89-132 (1928).

  • (5) - FOCK (V.) -   Näherungsmethoden zur Lösung des Quantenmechanischen Mehrkörperproblems.  -  Zeit. Physik, 61, p. 126-148 (1930).

  • (6) - SLATER (J.C.) -   The theory of complex spectra.  -  Phys. Rev., 34, p. 1293-1322 (1929).

  • ...

1 Sites Internet

Base de données de fonctions gaussiennes à l’usage de la chimie quantique http://bse.pnl.gov/bse/portal

Logiciel Molden http://www.cmbi.ru.nl/molden

Logiciel Molekel https://www.chemeurope.com/en/encyclopedia/Molekel.html

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