Bibliographie & annexes
Présentation
En anglais
RÉSUMÉ
L’utilisation de l’activité optique, en particulier à travers le dichroïsme circulaire, fait aujourd’hui partie des approches physico-chimiques classiquement utilisées dans les laboratoires de chimie et surtout des sciences de la vie. La connaissance de ce paramètre permet une meilleure compréhension des phénomènes fondamentaux du vivant. Après avoir introduit les différentes formes de polarisation de la lumière, cet article présente les principales caractéristiques de l’activité optique. Sont décrits ensuite les deux phénomènes essentiels et intimement liés, qui sont la rotation optique et surtout le dichroïsme circulaire. Différentes applications du dichroïsme circulaire pour l’étude des petites molécules et des biomolécules sont présentées.
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The use of optical activity, and in particular via circular dichroism, belongs to the most widely used physico-chemical approaches in chemistry and above all life science laboratories, to date. The knowledge of this parameter allows for a better understanding of the fundamental phenomena of living organisms. After introducing the various forms of light polarization, this article presents the main characteristics of optical activity. It then proceeds to describing two essential and strongly linked phenomena, namely the optical rotation and especially the circular dichroism. Various applications of the circular dichroism are presented for the study of small molecules and biomolecules.
Auteur(s)
-
Jean-Claude MAURIZOT : Ingénieur ENSCS - Directeur de recherche au CNRS - Centre de biophysique moléculaire (Orléans)
INTRODUCTION
Pratiquement tous les produits naturels, protéines, acides nucléiques, sucres, hormones, lipides, vitamines, antibiotiques, etc., manifestent le phénomène d’activité optique. Compte tenu du rôle important joué par les interactions entre ces différents types de molécules dans les processus biologiques, la connaissance de leur activité optique est cruciale pour la compréhension des phénomènes fondamentaux du vivant. De même la détermination de la chiralité ou de la pureté optique de certains composés est un élément extrêmement important dans l’industrie pharmaceutique ou alimentaire en raison des différences d’effets que peuvent présenter des isomères optiques.
La découverte de l’activité optique naturelle remonte au début du XIXe siècle avec Biot et Fresnel, et la première explication de l’origine de ce phénomène est due à Pasteur, en 1848. Ces avancées ont permis aux données de l’activité optique d’être parmi les premières utilisées, en particulier pour la caractérisation des molécules. La rotation molaire à la longueur d’onde de la raie D du sodium a longtemps été l’un des paramètres fournis dans la description d’un nouveau produit. Cependant, il a fallu attendre le milieu du XXe siècle pour que les mesures spectrales, en particulier la dispersion optique rotatoire, deviennent un outil utilisé en routine dans les laboratoires de chimie. Petit à petit, cette spectroscopie a laissé la place au dichroïsme circulaire qui est capable de fournir une information équivalente mais plus facile à mesurer et à interpréter que les spectres de dispersion optique rotatoire.
Dans un premier temps, nous décrirons la lumière (§ 1.) et ses différentes formes de polarisation (§ 2.) en nous basant principalement sur la théorie ondulatoire.
Après avoir décrit les principales caractéristiques de l’activité optique, nous présenterons les deux méthodes essentielles qui permettent de la mettre en évidence, la rotation optique et surtout le dichroïsme circulaire (§ 3.). Après avoir abordé les bases moléculaires de l’activité optique (§ 4.), nous donnerons des indications sur la manière de mesurer le dichroïsme circulaire (§ 5.). Enfin nous présenterons différentes applications du dichroïsme circulaire pour l’étude des petites molécules et des biomolécules (§ 6.).
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VERSIONS
- Version archivée 1 de avr. 1991 par Michel HENRY
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Rotation. Dichroïsme circulaire
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2. Lumière polarisée
2.1 Lumière polarisée dans un plan
Une lumière est dite « polarisée dans un plan » (figure 3) lorsque le champ électrique qui lui est associé se déplace en restant dans un même plan. Bien évidemment le champ magnétique reste dans un plan perpendiculaire au précédent. On emploie parfois le terme de « polarisation rectiligne ».
La lumière non polarisée, telle que la lumière dite « naturelle », est composée de lumières polarisées dans toutes les directions de façon aléatoire (figure 4) ; chaque onde successive se déplace dans un plan différent.
Quelques rares sources peuvent produire de la lumière polarisée. C'est le cas par exemple du rayonnement émis par les lasers ou par les synchrotrons. Mais la façon la plus classique de produire ce type de lumière est d'utiliser un polariseur.
Plusieurs phénomènes physiques peuvent être mis à profit pour polariser la lumière : pour une certaine incidence appelée « incidence de Brewster », un verre ne réfléchit que la lumière pour laquelle
possède une direction particulière ; cependant, cette méthode est peu efficace, car l'intensité de la lumière réfléchie est faible.
Certains cristaux donnent, pour un même rayon incident, deux rayons réfractés polarisés à angle droit. Le prisme de Nicol, obtenu en découpant un même monocristal perpendiculairement à son axe principal puis recollant les deux morceaux avec du baume du Canada, est conçu de façon à éliminer l'un des rayons. La lumière transmise est alors polarisée.
Les feuilles Polaroïds, mises au point par l'inventeur américain E. Land en 1932, sont constituées de fibres de polymères étirées. Celles-ci laissent passer la lumière polarisée perpendiculairement à la direction des fibres, tandis que la polarisation parallèle aux fibres est absorbée.
HAUT DE PAGE2.2 Lumière...
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Lumière polarisée
BIBLIOGRAPHIE
-
(1) - DRAKE (A.F.) - Polarisation modulation-the measurement of linear and circular dichroism - J. Phys. E : Sci. Instrum. 19 170-181 (1986).
-
(2) - LEWIS (J.W.), TILTON (R.F.), EINTERZ (C.M.), MILDER (S.J.), KUNTZ (I.D.), KLIGER (D.S.) - New technique for measuring circular dichroism changes on a nanosecond time scale - Application to (carbonmonoxy)myoglobin and (carbonmonoxy)haemoglobin. J. Phys. Chem. 89 (2), 289-294 (1985).
-
(3) - MOFFITT (W.), WOODWARD (R.B.), MOSCOWITZ (A.), KLYNE (W.), DJERASSI (C.) - Structure and the Optical Rotatory Dispersion of Saturated Ketones - J. Am. Chem. Soc. 83 (19) 4013–4018 (1961).
-
(4) - WELLMAN (K.M.), BRIGGS (W.S.), DJERASSI (C.) - Optical Rotatory Dispersion Studies. C. Variable-Temperature Circular Dichroism Studies of Ring-Conformational and Rotational Equilibria in Cyclohexanones - J. Am. Chem. Soc., 87 (1) 73-81 (1965).
-
(5) - GAWRONSKY (J.K.) - Circular Dichroism and Chirality of Dienes. In Circular Dichroism : Principles and Appplications - Second Edition N Berova, K. Nakanishi, RW Woody Eds. Wiley-VCH publishers, New York, p 305-335 (2000).
- ...
DANS NOS BASES DOCUMENTAIRES
Sites web permettant de télécharger des programmes d’analyse ou d’analyser en ligne les données de dichroïsme circulaire des protéines
http://lamar.colostate.edu/~sreeram/CDPro/
http://dichroweb.cryst.bbk.ac.uk/html/home.shtml
http://www.chem.elte.hu/departments/protnmr/cca/
http://dicroprot-pbil.ibcp.fr/
HAUT DE PAGE2.1 Constructeurs – Fournisseurs – Distributeurs
Appareils de mesure du dichroïsme circulaire
Applied Photophysics
Aviv Biomedical, Inc
http://www.avivbiomedical.com/
JASCO
http://www.jascofrance.fr/spectroscopy.html
OLIS Inc.
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