Présentation
En anglaisRÉSUMÉ
Cet article décrit les principes et les différentes techniques de l’analyse spatiale pour l’épidémiologie et la géographie de la santé : cartographie, analyse de l’hétérogénéité et de la continuité spatiale, recherche de tendances, de zones homogènes, recherche d’agrégats, recherche de formes géométriques, analyses spatio-temporelles, etc. L’analyse spatiale entre également dans le développement de nombreuses applications : modélisation des épidémies, systèmes d’alerte, systèmes de gestion de crises, systèmes de prévention et d’analyse de risques, préparation de campagne de vaccination, sondages.
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This article describes the principles and the different techniques of spatial analysis for epidemiology and health geography: mapping, analysis of heterogeneity and spatial continuity, trends, homogeneous areas, cluster detection, geometries, spatial-temporal analysis, etc. Spatial analysis is also used in the development of many applications: modelling of epidemics, warning systems, crisis management systems, risk prevention and analysis systems, vaccination campaigns, and surveys.
Auteur(s)
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Marc SOURIS : Directeur de recherche - IRD, unité mixte de recherche 190 « Émergence des pathologies virales », Marseille, France
INTRODUCTION
Cet article est une introduction à l’analyse spatiale pour l’épidémiologie et la géographie de la santé. Il a pour but de décrire les objectifs, les concepts, les méthodes et techniques disponibles dans ce domaine. Il s’adresse aux étudiants et aux professionnels de la santé publique, épidémiologistes, inspecteurs de la santé publique, géographes de la santé, spécialistes des rapports santé-environnement, que ce soit en santé humaine ou en santé animale. Il s’adresse également à tous ceux qui souhaitent une introduction aux méthodes générales de l’analyse spatiale.
L’analyse spatiale inclut toute technique qui étudie des objets et leurs relations en utilisant leurs propriétés topologiques ou géométriques. Cette définition est très générale et s’applique à de nombreux domaines : l’analyse spatiale est utilisée depuis de nombreuses années en géographie, en épidémiologie, mais également en biologie, en botanique, pour le traitement d’image, pour l’analyse de réseaux, dans l’électronique, en chimie, en climatologie, en hydrologie, en économie...
En épidémiologie (étude des facteurs influant sur la santé et les maladies dans une population) et en géographie de la santé (analyse géographique du système de santé et de la distribution spatiale des maladies), le terme d’analyse spatiale est utilisé pour décrire les techniques d’analyse appliquées aux « objets » décrits par l’épidémiologie ou la géographie, dès lors qu’ils sont localisés dans l’espace (les individus, les vecteurs, les réservoirs, les populations, les territoires, l’environnement naturel, l’environnement urbain, etc.). Est exclu ce qui se passe « dans » le malade (dans l’organe, dans la cellule, ou au niveau de la biologie de l’agent pathogène). Par exemple, cet article ne traite pas d’imagerie médicale et des techniques associées de traitement d’image, même si certaines de ces techniques sont parfois très proches de celles que nous décrirons.
Les phénomènes de santé sont rarement distribués de façon aléatoire dans l’espace. En effet, un phénomène de santé comporte bien souvent des facteurs de risques liés à des facteurs géographiques, à des facteurs environnementaux, aux relations spatiales entre les individus. Utiliser la localisation est donc fondamental dans l’analyse et la compréhension des phénomènes de santé et de leurs mécanismes : en prenant en compte les relations et interactions spatiales entre les acteurs de la maladie – vue comme un système complexe – l’analyse spatiale permet de mieux identifier et comprendre les mécanismes et les processus qui sous-tendent les phénomènes. L’analyse spatiale en épidémiologie offre ainsi des éléments qui permettent de consolider l’épidémiologie « classique » et d’enrichir la démarche des autres disciplines, et notamment de la géographie de la santé. Elle inclut l’analyse cartographique, la recherche de caractéristiques géométriques et spatio-temporelles, l’analyse de la continuité spatiale d’une valeur, la recherche d’agrégats, etc.
Dans le domaine de la santé, l’analyse spatiale n’est pas seulement utilisée pour des études en épidémiologie ou en géographie. Elle intervient également au niveau des politiques publiques, avec le développement de nouvelles applications en santé publique : systèmes d’alerte, systèmes de gestion de crises, systèmes de prévention et d’analyse de risques, préparation de campagne de vaccination.
L’utilisation de l’analyse spatiale dans le domaine de la santé s’est fortement accrue ces dernières années avec le développement de la géomatique et des systèmes d’information géographique (SIG). L’analyse spatiale bénéficie, comme dans d’autres domaines d’application, du développement des SIG et de la disponibilité grandissante de données géographiques, même si la qualité de ces données est encore souvent insuffisante. Il est difficile, sinon impossible, de ne pas utiliser un SIG pour gérer, transformer, manipuler, analyser, représenter l’information spatialisée. De nombreux logiciels sont facilement disponibles, que ce soit dans l’offre commerciale ou dans le domaine public (ArcGIS, QGIS, MapInfo, etc.). Le logiciel SIG utilisé pour illustrer cet article (SavGIS) et des exemples complets sont ainsi disponibles en téléchargement sur le site internet de SavGIS.
L’accent est mis dans cet article sur l’utilisation pratique des méthodes plutôt que sur les aspects théoriques de l’analyse spatiale, qui sont parfois complexes et que le lecteur pourra approfondir grâce à la bibliographie présentée à la fin de l’article. Néanmoins, les concepts généraux sur lesquels s’appuie la démarche sont présentés en cherchant toujours à expliquer les principes – qui, eux, sont souvent simples – utilisés dans telle ou telle méthode d’analyse, le plus clairement possible et en langage courant afin d’éviter si possible un jargon trop statistique.
Le premier chapitre présente les concepts généraux de l’analyse spatiale pour l’épidémiologie. Le second chapitre liste les types de données disponibles. Le troisième chapitre présente les méthodes de cartographie et de synthèse visuelle. Les paragraphes suivants sont consacrés aux méthodes d’analyse spatiale utilisées en épidémiologie et en géographie de la santé.
MOTS-CLÉS
Géomatique statistiques épidémiologie géographie de la santé analyse spatiale pour l'épidémiologie
KEYWORDS
Geomatics | statistics | epidemiology | health geography | spatial analysis for epidemiology
VERSIONS
- Version courante de déc. 2023 par Marc SOURIS
DOI (Digital Object Identifier)
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2. Données de santé pour l’analyse spatiale
Ce chapitre présente les données utilisées en épidémiologie et en géographie de la santé. Il détaille notamment les particularités dues à la localisation des données.
2.1 Sources de données de santé
Les principales sources sur les déterminants de l’état de santé ou du système de santé émanent des organismes publics ou privés de santé (hôpitaux, réseaux de pharmacies, ministère de la Santé, assurances maladies). Ces organismes fournissent des données sur le système de soins, sur le recours aux soins, sur la consommation de soins et de médicaments, au niveau individuel mais le plus souvent à un niveau agrégé. La qualité du recueil et de la gestion de données sanitaires varie d’un pays à l’autre, et souvent, notamment dans les pays en développement, d’une région à l’autre à l’intérieur du pays : les zones urbaines, densément peuplées, sont souvent bien mieux couvertes que les zones rurales où la densité est faible. On assiste bien souvent à un phénomène d’aveuglement : les régions les plus vulnérables d’un point de vue sanitaire sont également celles qui présentent une moindre qualité dans le report des données épidémiologiques.
Des enquêtes spécifiques sont menées lorsque l’on a besoin d’informations complémentaires sur la présence d’un pathogène, d’une maladie, ou sur les relations entre une variable de santé et un facteur de risque supposé. Observations, enquêtes, relevés, captures et mesures de terrain sont effectués pour caractériser la présence ou l’abondance d’un organisme, d’un vecteur ou d’un réservoir. Ces enquêtes utilisent le plus souvent des sondages, et ne recueillent pas de données exhaustives.
Des données environnementales (environnement naturel, urbain, technologique...) et démographiques sont indispensables pour la plupart des études concernant le risque. L’interprétation d’images satellitaires ou de photographies aériennes est également une importante source de données (utilisation du sol, température, humidité, état et type de végétation, etc.).
Les données épidémiologiques, au sens strict, concernent les données récoltées par le système de santé, ou par des enquêtes spécifiques...
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Données de santé pour l’analyse spatiale
BIBLIOGRAPHIE
-
(1) - ALBERT (D.), GESLER (W.), LEVERGOOD (B.) - Spatial analysis, GIS, and remote sensing applications in the health sciences. - Ann. Arbor Press (2000).
-
(2) - ANSELIN (L.) - Local indicators of spatial association – LISA. - Geographical Analysis, 27, p. 93-115 (1995).
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(3) - ANSELIN (L.) - The Moran Scatterplot as an ESDA tool to assess local instability in spatial association. - In FISCHER (M.), SCHOLTEN (H.), et UNWIN (D.) eds., Spatial Analytical Perspectives on GIS, Taylor and Francis, London, p. 111-125 (1996).
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(4) - AUCHINCLOSS (A.H.), DIEZ-ROUX (A.) - A new tool for epidemiology : the usefulness of dynamic-agent models in understanding place effects on health. - American Journal of Epidemiology, vol. 168, n° 1 (2008).
-
(5) - BARTLETT (M.S.) - The statistical analysis of spatial pattern. - Chapman and Hall (1975).
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...
ANNEXES
SavGis http://www.savgis.org
Réseau Sentinelles http://websenti.u707.jussieu.fr/sentinels
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