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Nouveaux outils d’étude des composants moléculaires de la cellule, les puces à ADN ont permis la mesure massivement parallèle de la concentration à l’équilibre des ARNm. Un grand nombre d’applications peuvent être envisagées comme l’étude des réseaux génétiques au sein d’une cellule ou l’obtention de signatures moléculaires caractéristiques d’un type de cellule, d’une pathologie ou d’un patient.
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De la notion de cellule à celle de transcriptome5. Conclusion
Les puces à ADN ont permis de réaliser un saut quantique dans l’analyse biologique. Il est maintenant possible d’analyser l’expression de milliers de gènes en parallèle et à haut débit. Des développements similaires commencent à apparaître pour l’analyse massivement parallèle des protéines ou d’autres composantes cellulaires.
Cette révolution technologique, ce changement d’échelle de la recherche biologique, va de pair avec une utilisation croissante de la robotique et de l’informatique. Les biologistes, traditionnellement confrontés à quelques dizaines de données expérimentales, vont devoir désormais apprendre à gérer des centaines de milliers de données. Grâce à ces technologies, il est vraisemblable que la biologie prendra une dimension théorique plus marquée.
Mots clés : puces à ADN, génomique fonctionnelle, bio-informatique, profils d’expression, transcriptome.
Keywords : DNA chips, functional genomics, bioinformatic, expression profiles, transcriptome.
Sites à consulter
National Human Genome Research Institute, National Institute of Health http://nhgri.nih.gov
Affymetrix http://www.affymetrix.com
National Institute of Environmental Health Sciences Microarray Center http://dir.niehs.nih.gov/microarray/bioinfor.htm
DNA Microarray (Genome chips) http://www.gene-chips.com/
European Bioinformatics Institute http://www.ebi.ac.uk/microarray/
De Risi Lab. Department of Biochemistry and Biophysics http://www.microarrays.org/protocols.html
The Institute for Genomic Research http://www.tigr.org/tdb/microarray/
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