Bibliographie & annexes
Présentation
Auteur(s)
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Christian DUTHEUIL : Ingénieur CNAM - Président de la Société française pour le développement de l’information en chimie (SFDIC )
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Lire l’articleINTRODUCTION
La chimie peut être considérée selon trois points de vue, l’un scientifique, l’autre technique, le troisième économique. Les interfaces entre les différentes sciences ont un contour flou comme le traduisent les disciplines de biochimie, biotechnologies, physico-chimie, étude des surfaces ou science des matériaux. Le détail de la couverture de Chemical Abstracts en est le reflet. En tant que technique, la chimie est impliquée dans les procédés de tous types, quel que soit le secteur économique considéré. L’éparpillement de la chimie dans les systèmes d’information pluridisciplinaires, tels Pascal ou Cedocar, en est la conséquence. Cette omniprésence de la chimie complique les opérations documentaires qui font appel à des sources dispersées et inhomogènes avec les problèmes inhérents (redondances, multiplicité des langages et des formats documentaires et informatiques...).
Avec le développement explosif d’Internet, de nouveaux phénomènes sont apparus :
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l’accès à de nouvelles sources d’information en grand nombre, plus ou moins structurées, plus ou moins fiables, qui ajoute sa part de problèmes, voire de confusion ;
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l’accès direct par l’utilisateur final aux sources d’information avec des outils de recherche prétendant travailler en langage naturel. La pertinence des données recueillies masque souvent les limites et les insuffisances de cette approche ;
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l’accès instantané à l’information, quasiment dès sa production, tant au niveau de la publication originale qu’au niveau du traitement documentaire. Cela représente sans conteste le principal atout, et non des moindres en matière d’innovation et de brevetabilité, de l’utilisation d’Internet ;
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le développement de sites spécialisés en chimie (sites portails) par les sociétés scientifiques et les associations professionnelles, par les universités et les centres de recherches publics.
Les besoins courants d’information en chimie ne se limitent pas aux domaines scientifiques et techniques ; ils sollicitent également les données économiques et les informations d’environnement industriel (propriété industrielle, normes et réglementations, sécurité et hygiène industrielle...).
Les adresses des sites internet, mentionnés dans l’article sont précisées dans la documentation (Pour en savoir plus [Doc. K 40]).
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VERSIONS
- Version archivée 1 de mai 1996 par Christian DUTHEUIL
DOI (Digital Object Identifier)
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Accueil > Ressources documentaires > Environnement - Sécurité > Métier : responsable risque chimique > Introduction aux constantes physico-chimiques > Banques de données en chimie > Données sur les séquences d’acides aminés
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Données à caractère économique13. Données sur les séquences d’acides aminés
Les sources documentaires sur ce sujet [1]Moyens d’information factuelle ne se contentent pas de décrire les séquences d’acides aminés, mais proposent des outils permettant la manipulation (séquençage, comparaison, degré de ressemblance...) des données à des fins d’identification ou d’élucidation structurale : des bibliothèques de programmes sont associées aux données de référence. Les principales sources sont souvent ressemblées sur le même serveur (de banques de données ou sur Internet) ou sur un CD-Rom. Le JICST et l’Université J. Hopkins de Baltimore produisent une banque rassemblant les données internationales sur les séquences du génome humain (GDB genome) accessible via Internet.
Les numéros de registre (RN) des séquences indexées dans Chemical Abstracts peuvent être recherchés sur le Registry File de CAS par la désignation du cloné, le nom du gène, l’organisme, des groupes de codes d’acides, la longueur de la séquence. La recherche se fait sous forme exacte, par famille, globalement, séquence par séquence.
La banque de données GENESEQ de Derwent Information Ltd recense les acides nucléiques (d’au moins 9 bases) et les séquences de protéines (d’au moins trois aminoacides) publiés dans les brevets de 40 offices nationaux et internationaux depuis 1981 (plus 550 000 acides nucléiques et plus de 200 000 séquences de proté-ines). Ces séquences ne sont pas reprises, pour la plupart, dans les banques de données publiques. Aux descriptions de séquences sont associés des outils pour la recherche d’enchaînements (GetSeq) et les recherches d’homologie et de similarité (GetSim).
Les principales banques de données publiques sont rassemblées par European Molecular Biology Laboratory de Heidelberg (Allemagne) (cf. ) et par European Bioinformatics Institute (cf. ) qui constitue ses ressources externes, mais ces banques de données conservent également leurs accès autonomes. Parmi celles-ci :
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Genseq de Intelligenetics Inc (États-Unis) ;
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Genbank, Swiss Rot et NBRF du National Research Council du Canada ;
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PDB du Brookhaven National Laboratory (États-Unis) ;
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PSEDIP de l’Institut Pasteur (France) ;
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JICST-DNA...
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BIBLIOGRAPHIE
-
(1) - DUTHEUIL (C.) - Moyens d’information factuelle - , , Techniques de l’Ingénieur (2002).
-
(2) - DEROULEDE (A.), DUTHEUIL (C) - Banques de données en thermodynamique - , , Techniques de l’Ingénieur (2002).
-
(3) - DUTHEUIL (C.) - Sources d’information en chimie analytique - , [P 13] Techniques de l’Ingénieur (2002).
-
(4) - MARX (B.) - Banques de données scientifiques et techniques - , [R 120], Techniques de l’Ingénieur (1997).
-
(5) - CA Subject Coverage Manuals - (10th CI édition ... 14th CI édition) Chemical Abstracts Service (Columbus, Ohio).
-
(6) - How to use Beilstein : Beilstein in keys - , Springer Verlag (Heidelberg).
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...
ANNEXES
Les adresses données peuvent être modifiées sans préavis. Une recherche sur un annuaire ou à l‘aide d‘un moteur de recherche permet, en général, d‘identifier la nouvelle adresse.
HAUT DE PAGE1.1 Organismes producteurs et diffuseurs de banques de données
American chemical society (ACS) http://www.acs.org
Centre de documentation de l’armement (CEDOCAR) (France) https://www.servicehistorique.sga.defense.gouv.fr/ark/47536
Chemical abstracts service (CAS) http://www.cas.org
Dechema (Allemagne) http://www.dechema.de
Derwent Ltd. (Grande-Bretagne) http://www.derwent.com
FIZ chemie-Fachinformationezentrum für chemie (Allemagne) http://www.Fiz-chemie.de
Gesellshaft deutscher chemiker (Allemagne, société chimique) http://www.gdch.de
Institut Belstein (Allemagne) https://www.beilstein-institut.de/en/ http://www.chemweb.com/databases/beilstein...
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