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RÉSUMÉ
Cet article décrit la préparation et les applications de nouvelles structures hybrides, composées de protéines variées (enzymes, anticorps...) et d'ADN de différentes tailles (oligonucléotide, petit ADN double brin, ADN géant). Il est montré en particulier comment, en combinant les propriétés biologiques et physico-chimiques de ces biopolymères essentiels à la vie, il est possible d'obtenir des nanostructures aux propriétés inédites, permettant des applications innovantes dans de nombreux domaines scientifiques qui vont de la biochimie aux nanotechnologies.
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Auteur(s)
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Anna VENANCIO-MARQUES : Doctorante au département de chimie de l'École normale supérieure de Paris, UMR 8640
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Sergii RUDIUK : Docteur, chargé de recherche CNRS au département de chimie de l'École normale supérieure de Paris, UMR 8640
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Damien BAIGL : Professeur à l'université de Pierre et Marie Curie Paris 6, département de chimie de l'École normale supérieure de Paris, UMR 8640
INTRODUCTION
Cet article décrit la préparation et les applications de nouvelles structures hybrides, composées de protéines variées (enzymes, anticorps, etc.) et d'ADN de différentes tailles (oligonucléotide, petit ADN double brin, ADN géant). Nous montrons en particulier comment, en combinant les propriétés biologiques et physico-chimiques de ces biopolymères essentiels à la vie, il est possible d'obtenir des nanostructures aux propriétés inédites, permettant des applications innovantes dans de nombreux domaines scientifiques qui vont de la biochimie aux nanotechnologies.
In this article, we review the preparation and the wide range of applications of new hybrid structures, which combine various proteins (enzymes, antibodies, etc...) with DNA of different lengths (oligonucleotides, small double stranded DNAs, giant DNAs). We show how bringing together the biological and physico-chemical properties of these two biologically essential polymers in a single entity leads to nanostructures with novel features, therefore paving the way for groundbreaking applications in scientific fields ranging from biochemistry to nanotechnology.
Bioconjugaison, AFM, microscopie de fluorescence, nanotechnologie, biotechnologie, combinaison de propriétés spécifiques ADN et protéine
Bioconjugation, AFM, fluorescence microscopy, nanotechnology, biotechnology, combining DNA and protein properties
Domaine : biotechnologie et nanotechnologie
Degré de diffusion de la technologie : Émergence | Croissance | Maturité
Technologies impliquées : purification de protéines, bioconjugaison, AFM, microscopie de fluorescence, cinétique enzymatique, métallisation, PCR
Domaines d'application : procédés biochimiques, bioanalyse, santé, nanoélectronique
Principaux acteurs français : ENS, UPMC, CNRS
Pôles de compétitivité :
Centres de compétence :
Industriels :
Autres acteurs dans le monde : Christof M. Niemeyer (Karlsruhe Institute of Technologie, Allemagne)
Contact : http://www.baigllab.com
DOI (Digital Object Identifier)
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4. Conjugués petits ADN-protéines
La partie ADN des conjugués petits ADN-protéines est sous forme de double brin. D'un point de vue de la fonctionnalité, cette caractéristique lui permet d'interagir avec un grand nombre de protéines agissant sur des ADN double brin, telles que les polymérases. D'un point de vue structurel, cet ADN possède une certaine rigidité. Deux applications innovantes mettent à profit ces propriétés.
4.1 Détection ultrasensible de protéines : immuno-PCR
Une application des conjugués petits ADN-protéines qui s'est avérée très utile dans le domaine des bioanalyses est la détection d'antigènes par « immuno-PCR » (figure 10) . Cette technique permet en effet d'augmenter la sensibilité de détection des antigènes de 100 à 10 000 fois par rapport à celle obtenue avec un test ELISA conventionnel. La technique de l'« immuno-PCR » combine la reconnaissance spécifique de la partie protéique (des anticorps) à l'amplification phénoménale de la partie ADN double brin par PCR.
HAUT DE PAGE4.2 Obtention de nanofils branchés par métallisation
Les propriétés structurelles et chimiques des petits ADN double brin peuvent être utilisées pour la fabrication de nouvelles nanostructures, en particulier l'obtention de nanofils par métallisation d'une matrice ADN.
HAUT DE PAGE4.2.1 Métallisation de brins d'ADN
La préparation de nanofils métalliques est possible depuis 1998 par métallisation de l'ADN ...
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Conjugués petits ADN-protéines
BIBLIOGRAPHIE
-
(1) - NIEMEYER (C.M.) - Semisynthetic DNA-protein conjugates for biosensing and nanofabrication. - Angew. Chem. Int. Ed., 49, no 7, p. 1200-1216 (2010).
-
(2) - HERMANSON (G.T.) - Bioconjugate Techniques - (2008).
-
(3) - BANO (F.), FRUK (L.), SANAVIO (B.), GLETTENBERG (M.), CASALIS (L.), NIEMEYER (C.M.), SCOLES (G.) - Toward multiprotein nanoarrays using nanografting and DNA directed immobilization of proteins. - Nano letters, 9, no 7, p. 2614-2618 (2009).
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(4) - WINSSINGER (N.), HARRIS (J.L.), BACKES (B.J.), SCHULTZ (P.G.) - From split-pool libraries to spatially addressable microarrays and its application to functional proteomic profiling. - Angew. Chem. Int. Ed., 40, no 17, p. 3152-3155 (2001).
-
(5) - COREY (D.R.), SCHULTZ (P.G.) - Generation of a hybrid sequence-specific single-stranded deoxyribonuclease. - Science, 238, no 4 832, p. 1401-1403 (déc. 1987).
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DANS NOS BASES DOCUMENTAIRES
ANNEXES
Conjugué protéine-ADN petit/géant
Site de l'équipe de BAIGL (D.) (École Normale Supérieure, Paris, France) http://www.baigllab.com/
Nanotechnologie ADN
Site de l'équipe de SEEMAN (N.C.) (New York University, NY, États-Unis) http://www.seemanlab4.chem.nyu.edu
Nanostructure biomoléculaire
Site de l'équipe de NIEMEYER (C.M.) (Karlsruhe Institute of Technologie, Allemagne) http://www.ibg.kit.edu/ibg1/193.php
Chimie biomoléculaire
Site de l'équipe de CARELL (T.) (Ludwig MaximiliansUniversität, Munich, Allemagne) http://www.cup.uni-muenchen.de/oc/carell/
Synthèse et propriétés d'assemblages moléculaires
Site de l'équipe de SCHULTZ (P.G.) (The Scripps Research Institute, San Diego, CA, États-Unis) http://www.schultz.scripps.edu/
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