Bibliographie & annexes
Présentation
English
RÉSUMÉ
Les nouvelles générations de systèmes de biopuces, les biopuces dynamiques, permettent d’accéder à la cinétique des interactions biomoléculaires et devraient révolutionner leurs caractérisations. Ces systèmes ont des applications tant en recherche qu’en outil de routine pour l’identification de signatures moléculaires. La méthode de choix repose actuellement sur des techniques d’imagerie en mode de résonance de plasmon de surface. La simplicité de l’utilisation des biopuces, ainsi que sa fiabilité, en font un outil majeur pour l’analyse généralisée, en temps réel et à faible coût, de molécules en faible quantité.
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Lire l’articleAuteur(s)
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Pierre LECARUYER : Doctorant au laboratoire Charles Fabry de l'Institut d'optique
-
Michael CANVA : Directeur de recherche - Laboratoire Charles Fabry de l'Institut d'optique - Institut d'optique Graduate School, Université Paris Sud, CNRS
INTRODUCTION
Nouvelles générations de systèmes de biopuces, les biopuces dynamiques permettent d'accéder à la cinétique des interactions biomoléculaires (figure 1) et devraient révolutionner leurs caractérisations. Ces systèmes peuvent avoir des applications tant en recherche qu'en outil de routine pour l'identification de signatures moléculaires. La méthode de choix repose actuellement sur des techniques d'imagerie en mode de résonance de plasmon de surface.
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Imagerie en mode de résonance de plasmon de surface (IRPS)
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2. Systèmes dynamiques : particularités
En comparaison avec les systèmes à biopuces « classiques statiques » , un des points clefs des biopuces dynamiques réside dans la possibilité de suivre « naturellement » en temps réel l’interaction de celles-ci avec des molécules à détecter et de permettre l'analyse des signatures des cinétiques d’interaction des molécules.
Si chaque cinétique est découpée en étapes, on peut décrire simplement toute interaction en 5 étapes et sa signature peut être vectorisée par 4 valeurs (τ on, Q d, τ off et Q s) caractéristiques d’une réaction chimique du premier ordre, illustrée figure 2 et caractérisée par la formule :
avec :
- τon et τoff :
- constantes de temps associées respectivement à l'hybridation et au lavage de la surface (concentration en cibles nulle),
- Qd et Qs :
- amplitudes des signaux à l'équilibre thermodynamique respectivement pour l'hybridation et le lavage.
Par convention, les molécules préalablement fixées à la surface de la biopuce...
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Systèmes dynamiques : particularités
BIBLIOGRAPHIE
-
(1) - SOULARUE (P.), GIDROL (X.) - Puces à ADN - [RE 6], Bioprocédés (2002).
-
(2) - GIDROL (X.), BAGHDOYAN (S.), ROUPIOZ (Y.) - Les biopuces - [RE 17], Bioprocédés (2004).
-
(3) - LECARUYER (P.), MANNELLI (I.), COURTOIS (V.), GOOSSENS (M.), CANVA (M.) - Surface plasmon resonance imaging as a multidimensional surface characterization instrument – application to biochip genotyping - Analytica Chimica Acta 573, 533-540 (2006).
-
(4) - L. MOISEEV (L.), SELIM UNLU (M.), SWAN (A.K.), GOLDBERG (B.B.), CANTOR (C.R.) - DNA conformation on surfaces measured by fluorescence self-interference - PNAS 2006, 103, n° 8, 2623-2628 (2006).
-
(5) - LECARUYER (P.), MAILLART (E.), CANVA (M.), ROLLAND (J.) - Generalization of the Rouard method to an absorbing thin film stack and application to surface plasmon resonance - Applied Optics, 45, Issue 33, 8419-8423 (2006).
-
(6)...
ANNEXES
Catalogue en ligne http://www.abes.fr/abes/index.html
Thèses disponibles en ligne http://tel.archives-ouvertes.fr/
HAUT DE PAGE
Brevet FR n° 05 12 594, « Procédé d'auto-calibration de biopuces » – CNRS (13/12/2005). Étendu international PCT/EP2006/069683 – (13/12/2006).
HAUT DE PAGE3.1 Constructeurs. Fournisseurs. Distributeurs (liste non exhaustive)
ACEA Biosciences http://www.aceabio.com/Products/index.htm
Affymetrix http://www.affymetrix.com/index.affx
Akubio http://www.akubio.com/
Applied Biophysics ...
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