Domaines d'applications
Biopuces dynamiques et imagerie en mode de plasmon de surface

Les domaines d'application pour les biopuces dynamiques sont très vastes et variés. Ils s'étendent des domaines de la pharmacologie à la médecine en passant par la défense, l'environnement ou l'agro-alimentaire    .

Dans le domaine même de la médecine, les champs sont vastes, allant de l'étude d'interactions ADN:ADN à ADN:protéines , protéines:protéines en passant par antigènes:anticorps  ou enzyme:substrat. La nouvelle configuration du système en imagerie par résonance de plasmon de surface a rendu les systèmes de biopuces de plus en plus adaptés à l'analyse en parallèle d'un très grand nombre de molécules apportant un gain de temps et de produits extrêmement précieux.

De manière générale, le principe de reconnaissance d'une biomolécule utilisé pour les interactions ADN:ADN, ADN:protéine, anticorps:antigènes, etc. est basé sur la capacité à différencier deux ou plusieurs signaux issus d'interactions totalement complémentaires et d'interactions quasicomplémentaires en prenant pour témoin un troisième signal censé rester inerte. Le diagnostic génétique est un des domaines qui bénéficie le plus des progrès des biopuces, car il est le plus « simple » et ne nécessite au final qu'une conclusion qualitative fiable. Il est basé sur la reconnaissance de simples brins d'ADN. En effet, l'ADN existe naturellement sous sa forme hélicoïdale double brin. Le principe de ces biopuces va être de greffer des simples brins appelés sondes sur la surface sensible et d'observer l'interaction de ces brins avec d'autres fragments d'ADN complémentaires à analyser appelés cibles, préalablement également préparés sous forme de simple brin.

Dans le cas du diagnostic génétique, le but est de détecter les mutations génétiques dynamiques ou ponctuelles (délétion, insertion ou substitution) afin de déterminer les causes de certaines maladies. La délétion et l'insertion signifient qu'un nucléotide manque ou est ajouté à une séquence du génome et la substitution signifie qu'un nucléotide d'une séquence est remplacé par un autre nucléotide. Pour ce faire, deux brins vont être greffés sur la surface : le premier sera parfaitement complémentaire à l'ADN cible « dit normal » alors que le second sera complémentaire de la même séquence dans sa version « dite mutante »....