Présentation

Article

1 - ASPECTS PRATIQUES DE L’IMAGERIE DE L’ADN PAR AFM

2 - SURFACES ET IMAGERIE PAR AFM DES ACIDES NUCLÉIQUES

3 - APPLICATIONS

4 - CONCLUSION

Article de référence | Réf : RE115 v1

Conclusion
Techniques d'observation des acides nucléiques et des complexes nucléoprotéiques par AFM

Auteur(s) : Loïc HAMON, Patrick A. curmi, David PASTRE

Relu et validé le 01 janv. 2023

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RÉSUMÉ

L'expérimentateur qui souhaite observer des biomolécules peut choisir parmi plusieurs systèmes d’imagerie, dont la microscopie à force atomique (AFM). L'obtention d'une image par AFM se fait par le balayage d'une surface par un microlevier terminé par une pointe de dimension nanométrique. Les déplacements du microlevier sont commandés par les déformations d'une céramique piézo-électrique sous l'effet de la tension qui lui est appliquée. Ainsi interagissent la surface du substrat, l’ADN et éventuellement des protéines. Après un rappel des principes de base de fonctionnement de l’AFM, cet article permet d’établir théoriquement et expérimentalement les conditions pour l’obtention d’informations pertinentes concernant l'interaction propre entre les biomolécules. Les améliorations de cette technique reposent essentiellement sur l’augmentation de la résolution latérale et de la vitesse de balayage.

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ABSTRACT

Observation techniques of nucleic acids and nucleoprotein complexes by AFM

The experimenter who whishes to observe biomolecules can choose between several systems of imagery, including the atomic force microscopy (AFM). Obtaining an image via AFM is achieved by scanning a surface with a microlever ending in a nanometer-sized point. The movements of the microlever are controlled by the deformations of a piezo-electric ceramic under the effects of the applied voltage. Thus the surface of the substrate, the DNA and possibly proteins interact. After having recalled the basic operating principles of the AFM, this article allows for the theoretical and experimental establishment of the conditions for obtaining accurate information concerning the specific interaction between the biomolecules. This technique is essentially improved by increasing the lateral resolution and the scanning speed.

Auteur(s)

INTRODUCTION

Dans un système d'imagerie biomoléculaire comme la microscopie à force atomique (AFM) où plusieurs partenaires interagissent, ici la surface du substrat, l'ADN et éventuellement des protéines, il est primordial d'établir théoriquement et expérimentalement les conditions permettant d'obtenir des informations biologiquement pertinentes concernant l'interaction propre entre les biomolécules.

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DOI (Digital Object Identifier)

https://doi.org/10.51257/a-v1-re115


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4. Conclusion

La fréquence des publications annuelles concernant l'étude d'ADN et de complexes ADN/protéine est en constante augmentation depuis le milieu des années 1990. Suite à un travail de fond sur les mécanismes physico-chimiques régissant l'adsorption de l'ADN sur le mica, l'observation des phénomènes biologiques par AFM devient de plus en plus pertinente et permet d'éviter les quelques interprétations hasardeuses que l'on peut trouver dans certaines publications de la fin des années 1990.

Les perspectives d'amélioration de la technique sur notre thématique d'intérêt reposent sur deux points :

  • la généralisation de microleviers portant des pointes encore plus fines pour augmenter la résolution latérale des images AFM. Des études utilisant par exemple des nanotubes de carbone greffés sur le microlevier pour l'imagerie de biomolécules vont dans ce sens  ;

  • l'augmentation de la vitesse de balayage  . Une des possibilités est d'utiliser de petits microleviers ayant une fréquence de résonance très élevée, supérieure à 1 MHz...

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BIBLIOGRAPHIE

  • (1) - RIVOAL (J.C.), FRETIGNY (C.) -   Microscopie à Force Atomique.  -  [R 1 394], Mesures – Essais (2005).

  • (2) - HANSMA (H.G.) -   Surface biology of DNA by atomic force microscopy.  -  Annu. Rev. Phys. Chem., 52, p. 71-92 (2001).

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  • (4) - MÜLLER (D.J.), SAPRA (K.T.), SCHEURING (S.), KEDROV (A.), FREDERIX (P.L.), FOTIADIS (D.), ENGEL (A.) -   Single-molecule studies of membrane proteins. Current Opinion in Structural Biology.  -  16/4, p. 489-495 (2006).

  • (5) - MILHIET (P.E.), GIOCONDI (M.C.), LE GRIMELLEC (C.) -   Cholesterol is not crucial for the existence of microdomains in kidney brush-border membrane models.  -  J. Biol. Chem., 277, p. 875-878 (2002).

  • (6) - PASHLEY (R.M.) -   Hydration...

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