Bibliographie & annexes
Présentation
RÉSUMÉ
La spectrométrie de masse est une technique analytique extrêmement importante pour l'identification de molécules, ceci par la mesure du rapport masse sur charge (m/z) de l'espèce ionisée ou de ses fragments. Le couplage avec un laser apporte une dimension nouvelle à la spectrométrie de masse. En effet, grâce au contrôle de l'excitation de l'ion via l'énergie de la lumière utilisée, la nature et la position des chromophores, la durée temporelle de l'impulsion lumineuse et sa puissance, cette technique d’excitation ouvre la voie vers un contrôle de la fragmentation des ions, une fragmentation sélective d'un isomère donné, la mesure du spectre d'absorption optique d'ions isolés... Ainsi, au-delà de l'analyse structurelle, le couplage spectroscopie optique-spectrométrie de masse permet l'étude conformationnelle et dynamique de biomolécules isolées ou dans un environnement contrôlé.
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INTRODUCTION
La spectrométrie de masse est une technique analytique extrêmement importante pour l'identification de molécules, ceci par la mesure du rapport masse sur charge (m/z) de l'espèce ionisée ou de ses fragments. La spectroscopie UV-visible permet de sonder les propriétés électroniques et structurelles d'une molécule ou d'un ion. Ces deux approches peuvent être couplées dans des expériences de photodissociation et de photodétachement d'électron sur des biomolécules piégées.
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Spectroscopie d'action : vers une sonde structurelle d'ions en phase gazeuse4. Activation des radicaux photo-induits : outil pour l'identification de protéines
4.1 Principe
Les radicaux obtenus après irradiation laser peuvent être isolés dans le piège (MS2) puis réexcités par activation collisionnelle (MS3). L'activation d'un ion radicalaire conduit à des mécanismes de fragmentation très différents de ceux obtenus sur un ion non radicalaire. Il est notamment possible de fragmenter des liaisons covalentes (en particulier du squelette) tout en conservant des liaisons faibles, ce qui trouve une application particulièrement pertinente pour l'étude des complexes non covalents ou des modifications posttraductionnelles.
HAUT DE PAGE4.2 Application à la caractérisation de sites de phosphorylation
La figure montre les résultats obtenus sur un même peptide phosphorylé en modes positif et négatif , . L'activation collisionnelle de ce peptide (directement issu de la source electrospray) conduit majoritairement à la perte du phosphate avec très peu d'information sur sa séquence. La figure a montre un spectre obtenu par CAD sur le radical obtenu par photoclivage du chromophore à partir de l'ion doublement protoné. Une fragmentation efficace du squelette est observée (fragments a et b) avec une inhibition complète de la perte de la modification posttraductionnelle. Sur la figure b, le radical a été obtenu par photodétachement d'un électron à partir de l'espèce doublement déprotonée. L'activation collisionnelle du radical [M-2H]- conduit également à une fragmentation efficace du squelette. Les fragments obtenus (a et x) avec cette technique dénommée EPD (electron photodetachment dissociation) , sont similaires à ceux observés par les techniques ETD (electron transfer dissociation) et EDD (electron detachment dissociation) .
HAUT DE PAGE4.3 Application à un mélange peptidique issu d'une digestion de protéine
En protéomique, l'identification de protéines est réalisée de manière routinière par spectrométrie de masse combinée à des outils bio-informatiques. La technique utilisée consiste à enregistrer par spectrométrie...
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BIBLIOGRAPHIE
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