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Article de référence | Réf : P2717 v1

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CDMS – Spectrométrie de masse à détection de charge

Auteur(s) : Rodolphe ANTOINE

Date de publication : 10 mars 2021

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RÉSUMÉ

La spectrométrie de masse à détection de charge CDMS est une méthode à ion unique où la masse de chaque ion est directement déterminée à partir de mesures de son rapport masse/charge et de sa charge. Cette technique émergente s’avère particulièrement pertinente pour la caractérisation d’analytes hétérogènes et de masse élevée. Depuis la fin des années 2000, la technique CDMS a connu une renaissance, et grâce aux développements techniques, a conquis le nanomonde. Dans cet article sont décrits le principe et les trois principaux modes de fonctionnement CDMS ainsi que ses couplages. Un aperçu des applications récentes est donné.

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Auteur(s)

  • Rodolphe ANTOINE : Directeur de recherche au CNRS, Institut Lumière Matière, UMR5306 CNRS, Université Claude Bernard Lyon 1

INTRODUCTION

La spectrométrie de masse (MS) est un outil analytique incontournable pour la caractérisation et l’identification de molécules. La séparation des molécules selon leur rapport masse/charge (m/z) préalablement ionisées à partir d’un échantillon repose sur l’action d’un champ électromagnétique. Les spectromètres de masse conventionnels fournissent ainsi généralement un spectre en m/z duquel doivent être identifiés le ou les états de charge z d’un composé de masse donnée m. La détermination de la masse m du composé découle de cette analyse spectrale. Les spectromètres de masse conventionnels sont bien adaptés à l’analyse de molécules de masse bien définie et allant de quelques dizaines de daltons (Da) jusqu’à quelques dizaines de kilodaltons (kDa) couvrant notamment le domaine d’analyse des peptides et petites protéines, pour lequel la technique d’ionisation par electrospray (ESI) produisant des ions très chargés s’avère particulièrement bien adaptée. En revanche, si on considère un échantillon constitué de molécules de masse plus élevée, typiquement à partir du mégadalton (MDa) et au-delà, la résolution du spectre devient impossible. Une limite de masse mesurable par technique conventionnelle ESI-MS a été établie autour de 20 MDa. Pour les espèces qui sont intrinsèquement hétérogènes, cette limite est considérablement plus faible. En effet, les états de charge deviennent plus élevés, plus nombreux et plus proches les uns des autres sur le spectre. En outre, l’hétérogénéité des ions étudiés augmente avec la masse du fait de la présence plus ou moins importante d’espèces co-adsorbées (molécules d’eau, contre-ions et autres adduits). Enfin, l’étude d’échantillons intrinsèquement polydisperses tels que des polymères synthétiques ou des nanoparticules est une barrière supplémentaire à la résolution de ce type de spectres en m/z.

Ainsi, il existe un intervalle de masse que les techniques MS conventionnelles ne couvrent pas. Et dans cet intervalle se trouvent, dans une large mesure, les masses des composés ou objets (qu’ils soient naturels ou façonnés par l’homme) appartenant au « nanomonde ». Il apparaît donc important de combler ce « vide » analytique dans la détermination de la masse.

Basée sur la détection de la charge-image à partir d’un ion multichargé individuel traversant un tube conducteur, la spectrométrie de masse à détection de charge permet de mesurer simultanément la charge et le temps de vol dans ce tube (ToF) de chaque ion issu de l’échantillon. Cette technique de spectrométrie de masse – à ions uniques – permet d’étendre le domaine d’analyse de la spectrométrie de masse conventionnelle vers le « nanomonde » en évaluant le caractère polydisperse de l’échantillon. L’énorme intérêt de cette technique réside en effet dans sa capacité à produire de réelles distributions de masse et de charge pour des échantillons présentant pour la plupart un caractère fortement polydisperse.

Pionnier dans le développement de cette technique de spectrométrie de masse couplée à l’ESI, W.H. Benner et ses collaborateurs aux États-Unis ont notamment établi la preuve-de-concept en étudiant des macro-ions d’ADN ou des virus entiers de masse allant de quelques MDa à quelques dizaines de MDa. À ce jour, plusieurs équipes de recherche (principalement aux États-Unis d’Amérique) sont actives dans le développement instrumental de cette technique. Les équipes de M.F. Jarrold et E.R. Williams s’attachent à développer des réseaux de détecteurs de charge ainsi que des couplages avec des pièges électrostatiques pour améliorer la sensibilité et la précision de cette technique. L’équipe de D.E. Austin, quant à elle, s’ingénie à miniaturiser cette technique sur des circuits imprimés. Enfin, l’équipe de R. Antoine développe des couplages CDMS avec des techniques séparatives et de la spectroscopie laser.

La masse moléculaire, somme des masses atomiques des différents atomes constituant une molécule, s’exprime en -Dalton qui est la masse d’un atome d’hydrogène :

1Da=1,66× 10 27 kg

On retiendra que 1 Da correspond à une masse molaire de 1 g/mol.

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MOTS-CLÉS

Virus Détection d'ion

DOI (Digital Object Identifier)

https://doi.org/10.51257/a-v1-p2717


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4. Applications

4.1 Polynucléotides d’ADN et d’ARN

Les polynucléotides d’ADN et d’ARN furent les premiers objets à être étudiés par spectrométrie CDMS. En effet, le groupe de Benner, dès 1995-1997, a démontré le potentiel du CDMS pour l’analyse des polynucléotides de masse moléculaire connue (entre 2,8 et 31 MDa)  . L’analyse CDMS des ions ADN a fourni des informations nouvelles telle la corrélation entre la charge et la masse des ions pouvant fournir des informations sur la « morphologie » des macromolécules, comme une conformation « étendue » pour les ADN du λ-phage.

Un des gros avantages de la technique CDMS à simple passage est encore une fois le temps d’analyse : une séparation par gel prend 4 h de temps d’analyse et l’analyse CDMS prend moins de 10 min. Par ailleurs, la technique CDMS-simple passage a également trouvé un intérêt pour analyser les produits de réaction en chaîne de la polymérase (PCR) avec des longueurs de paires de base entre 1 525 et 2 677. Bien que la résolution en masse soit limitée, l’avantage de la CDMS réside dans sa rapidité d’analyse et sa capacité à mesurer des produits sans préparation de l’échantillon.

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4.2 Assemblages de protéines et fibres amyloïdes

Les améliorations apportées à l’instrumentation et aux méthodes d’analyse...

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BIBLIOGRAPHIE

  • (1) - ANTOINE (R.) -   Weighing synthetic polymers of ultra-high molar mass and polymeric nanomaterials : what can we learn from charge detection mass spectrometry ?.  -  Rapid Communications in Mass Spectrometry, 34(S2), p. e8539 (2020).

  • (2) - KEIFER (D.Z.), PIERSON (E.E.), JARROLD (M.F.) -   Charge detection mass spectrometry : weighing heavier things.  -  Analyst, 142(10), p. 1654-1671 (2017).

  • (3) - KEIFER (D.Z.), JARROLD (M.F.) -   Single-molecule mass spectrometry.  -  Mass Spectrometry Reviews, 36(6), p. 715-733 (2017).

  • (4) - FUERSTENAU (S.D.), BENNER (W.H.) -   Molecular weight determination of megadalton DNA electrospray ions using charge detection time-of-flight mass spectrometry.  -  Rapid Communications in Mass Spectrometry, 9(15), p. 1528-1538 (1995).

  • (5) - FUERSTENAU (S.D.), BENNER (W.H.), THOMAS (J.J.), BRUGIDOU (C.), BOTHNER (B.), SIUZDAK (G.) -   Mass spectrometry of an intact virus.  -  Angewandte Chemie International Edition, 40(3), p. 541-544 (2001).

  • ...

1 Brevets

Apparatus and method of determining molecular weight of large molecules US5770857A

Charge detection mass spectrometer with multiple detection stages WO2012083031A1

HAUT DE PAGE

2 Annuaire

HAUT DE PAGE

2.1 Start-up (liste non exhaustive)

Megadalton Solutions, pour l’analyse pour compagnies pharmaceutiques

Indiana University, JARROLD (M.F.), CLEMMER (D.E.) et DRAPER (B.E.) https://megadaltonsolutions.com

HAUT DE PAGE

2.2 Laboratoires développant de l’instrumentation CDMS (liste non exhaustive)

JARROLD (M.F.), Indiana University Bloomington, États-Unis https://nano.lab.indiana.edu

ANTOINE (R.), CNRS et Université de Lyon, France https://ilm.univ-lyon1.fr

WILLIAMS (E.R.), University of California, Berkeley, États-Unis http://www.cchem.berkeley.edu

AUSTIN (D.E.), Brigham Young University,...

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