Bibliographie & annexes
Présentation
En anglais
RÉSUMÉ
Les systèmes marins côtiers sont fréquemment contaminés par des hydrocarbures d’origine anthropique qui font partie des contaminants majoritaires du milieu. Plusieurs stratégies de réhabilitation biologique (bioremédiation) peuvent être mises en place. Celles-ci sont basées sur la stimulation des capacités métaboliques naturelles des micro-organismes autochtones (biostimulation) ou sur l’ajout de souches ou consortia microbiens dans le milieu à dépolluer (bioaugmentation). Parfois, la meilleure réponse peut toutefois consister à ne pas intervenir et à laisser les processus naturels d’autoépuration agir (atténuation naturelle).
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Anthropogenic hydrocarbons are among the most abundant contaminants of coastal ecosystems. Several remediation strategies of hydrocarbon-contaminated areas involving microorganisms (bioremediation) can be successfully used to mitigate the contamination. The hydrocarbonoclastic activities of indigenous microorganisms can be stimulated (biostimulation) by the addition of nutritional supplements (fertilizers), (bio)surfactants, terminal electron acceptors (e.g., O2, NO3-) or by electrostimulation. Selected strains/mixed cultures can be also added in the contaminated environments (bioaugmentation). Sometimes, however, to best strategy is to let the natural mitigation processes run and to monitor the natural recovery without any human intervention.
Auteur(s)
-
Philippe CUNY : Aix-Marseille univ., université de Toulon, CNRS, IRD, MIO, Marseille, France
-
Cécile MILITON : Aix-Marseille univ., université de Toulon, CNRS, IRD, MIO, Marseille, France
INTRODUCTION
Les hydrocarbures sont parmi les contaminants les plus abondants des systèmes marins côtiers. De nombreuses zones côtières à travers le monde sont en effet soumises à des apports chroniques de ces composés, apports qui peuvent être parfois massifs (marées noires). Leur dynamique dans le milieu est complexe et fait intervenir de nombreux processus, abiotiques et biotiques, qui interagissent. Parmi ceux-ci, la biodégradation des hydrocarbures, effectuée par des micro-organismes parfois spécialisés dans leur utilisation (qualifiés d’« hydrocarbonoclastes »), permet leur élimination effective en conditions oxiques mais aussi anoxiques tant dans l’eau de mer que dans les sédiments. Elle peut intervenir dans une vaste gamme de conditions physico-chimiques de température, de pH ou encore de salinité. Ceci en fait un processus de choix pour le génie écologique afin de dépolluer (bioremédiation) les écosystèmes marins pollués aux hydrocarbures. Les différentes stratégies de bioremédiation visent à stimuler (biostimulation) les capacités cataboliques naturelles de la communauté microbienne indigène du milieu côtier pollué. La stimulation peut se faire par ajout de nutriments (fertiliseurs), de (bio)surfactants, d’accepteurs terminaux d’électrons (e.g. O2,
ou encore grâce à des procédés électrochimiques (électrostimulation). Une autre stratégie peut consister à introduire dans le milieu pollué des souches/cultures mixtes hydrocarbonoclastes choisies pour leurs capacités à dégrader les hydrocarbures (bioaugmentation) et qui peuvent avoir été isolées de ce même milieu. Plusieurs de ces stratégies peuvent aussi être associées (e.g. ajout combiné de fertiliseurs et de biosurfactants).
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MOTS-CLÉS
KEYWORDS
bioremediation | biostimulation | bioaugmentation
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Contamination par les hydrocarbures dans les écosystèmes marins côtiers
En anglais
5. Glossaire
Bioaugmentation ; Bioaugmentation
Procédé de bioremédiation in situ ou ex situ qui consiste à augmenter la capacité biologique d’épuration d’un site ou de déchets pollués via l’introduction de micro-organismes sélectionnés pour leur grande capacité à biodégrader certains contaminants.
Biodégradation ; Biodegradation
Dégradation biologique des contaminants organiques qui fait intervenir des systèmes enzymatiques cataboliques spécifiques synthétisés par certains organismes.
Bioremédiation ; Bioremediation
Processus d’atténuation d’une contamination par la stimulation des capacités métaboliques de la communauté microbienne indigène (biostimulation) ou par l’ajout de micro-organismes sélectionnés pour leurs capacités à biodégrader des contaminants (bioaugmentation).
Biostimulation ; Biostimulation
Stimulation des capacités de biodégradation des contaminants d’une communauté microbienne par l’ajout de nutriments (fertilisants), de (bio)surfactants, d’accepteurs terminaux d’électrons ou par électrostimulation.
Hydrocarbonoclaste ; Hydrocarbonoclastic
Capacité d’un micro-organisme à métaboliser, parfois comme seule source de carbone et d’énergie, certains hydrocarbures.
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Glossaire
BIBLIOGRAPHIE
-
(1) - BEAUDOIN (D.J.), CARMICHAEL (C.A.), NELSON (R.K.), REDDY (C.M.), TESKE (A.P.), EDGCOMB (V.P.) - Impact of protists on a hydrocarbon-degrading bacterial community from deep-sea Gulf of Mexico sediments : A microcosm study. - Deep Sea Research Part II : Topical Studies in Oceanography, 129, p. 350-359 (2016).
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(2) - BRAGG (J.R.), PRINCE (R.C.), HARNER (E.J.), ATLAS (R.M.) - Effectiveness of bioremediation for the ExxonValdez oil spill. - Nature, 368, p. 413-418 (1994).
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(4) - CHEN (Q.), LI (J.), LIU (M.), SUN (H.), BAO (M.) - Study on the biodegradation of crude oil by free and immobilized bacterial consortium in marine environment. - PLoS ONE, 12(3), p. e0174445. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0174445 (2017).
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(5) - CRISAFI (F.), GENOVESE (M.), SMEDILE (F.), RUSSO (D.), CATALFAMO (M.), YAKIMOV (M.), GIULIANO (L.), DENARO (R.) - Bioremediation technologies for polluted seawater sampled after an oil-spill...
ANNEXES
(liste non exhaustive)
Directive 2005/35/CE du Parlement européen et du Conseil du 7 septembre 2005 relative à la pollution causée par les navires et à l'introduction de sanctions en cas d'infractions (JORF du 30 septembre 2005).
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