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1 - DONNÉES

2 - MODÈLES NON LINÉAIRES À EFFETS MIXTES

3 - MÉTHODES D'ESTIMATION

4 - CONSTRUCTION ET ÉVALUATION DE MODÈLES

5 - PROTOCOLES

6 - CONCLUSION ET PERSPECTIVES

Article de référence | Réf : PHA1010 v1

Construction et évaluation de modèles
Pharmacométrie

Auteur(s) : Caroline BAZZOLI, Julie BERTRAND, Emmanuelle comets

Relu et validé le 29 mai 2020

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RÉSUMÉ

La pharmacométrie regroupe les techniques permettant de quantifier l'activité pharmacologique d'un médicament, ainsi que sa variabilité d'un sujet et/ou d'une occasion à l'autre. Ces techniques reposent essentiellement sur l'utilisation de modèles non linéaires à effets mixtes (MNLEM). Le présent article introduit les caractéristiques des données pharmacologiques et comment les MNLEM y apportent une réponse statistique. Les méthodes d'estimation, de test et d'évaluation de ces modèles, de même que leur utilisation pour l'évaluation et l'optimisation des protocoles cliniques, sont décrites et illustrées par une application à la pharmacologie de la warfarine, un anticoagulant de la famille des antivitamines K.

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Auteur(s)

  • Caroline BAZZOLI : Maître de conférences Laboratoire Jean Kuntzmann, Département Statistique, Université de Grenoble, France

  • Julie BERTRAND : MRC Research Fellow UCL Genetics Institute, University college of London, London, United Kingdom

  • Emmanuelle comets : Chargée de recherches INSERM INSERM IAME, UMR 1137, F-75018 Paris ; Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, F-75018 Paris ; INSERM, CIC 1414, Université Rennes 1, Rennes, France

INTRODUCTION

La pharmacométrie se définit comme la science de la pharmacologie clinique quantitative. La pharmacologie étudie l'interaction entre notre organisme et le médicament, ce terme désignant « toute substance ou composition […] exerçant une action pharmacologique, immunologique ou métabolique » (article L. 5111-1 du Code de la santé publique). Cette interaction bidirectionnelle recouvre la pharmacocinétique (PK), ce que notre organisme fait subir au médicament, et la pharmacodynamie (PD), ce que le médicament fait subir à notre organisme.

La PK est principalement étudiée au travers de l'évolution de la concentration en fonction du temps, souvent résumée par des paramètres comme l'aire sous la courbe (AUC), mesurant l'exposition totale, et de la demi-vie, définie comme le temps requis pour diminuer de moitié la quantité de médicament dans le système.

L'activité PD est, quant à elle, plus diverse dans sa nature. Les marqueurs de cette activité dépendent de la réponse considérée, biologique ou clinique, continue ou discrète. L'étude conjointe de la PK et de la PD d'un médicament permet de définir la marge thérapeutique comprise entre les doses ou les concentrations minimale et maximale requises pour observer un niveau de réponse respectivement efficace et toxique.

Les marqueurs PK/PD sont recueillis au cours du développement du médicament chez des volontaires sains en phase I, puis chez des patients en phase II, avec respectivement un accent sur la toxicité puis l'efficacité. Dès la phase II, et jusqu'en routine clinique, la variabilité présente entre les sujets (dite inter-sujet ou interindividuelle) est quantifiée et explorée afin de pouvoir en définir les sources et évaluer la nécessité d'une personnalisation du traitement à travers la dose et/ou la posologie.

La pharmacométrie regroupe les techniques permettant de caractériser l'activité PK et PD, et dans quelle mesure cette activité varie d'un sujet et/ou d'une occasion à l'autre, ainsi que de prédire et de simuler ces activités afin de fournir des critères rationnels à la prise de décision. Cette discipline a pris son essor lors des dernières décades, avec le développement de méthodes dites « de population », reposant sur l'utilisation des modèles non linéaires à effets mixtes. Ces méthodes contrastent avec les analyses en deux étapes utilisées auparavant : les marqueurs de l'activité PK et PD étaient estimés individuellement, puis leur valeur moyenne et leur variabilité calculées. L'estimation individuelle nécessite un nombre élevé de prélèvements par sujet, et n'est utilisable que dans les études précoces lors du développement clinique. Dans les études ultérieures, où le nombre de patients est plus grand, mais le nombre de prélèvements par patient réduit, ou dans les populations fragiles (patients immunodéprimés, personnes âgés, patients avec des pathologies concomitantes, enfants…), où le nombre de prélèvements doit rester minimal, les approches de population permettent d'analyser toutes les observations simultanément et s'aident des sujets avec plus de prélèvements pour inférer les sujets moins informatifs, en s'appuyant sur des hypothèses statistiques et mécanistiques.

Cet article présente les données rencontrées en pharmacologie clinique, les modèles dynamiques et statistiques qui sous-tendent l'approche de population, puis les méthodes d'estimation des paramètres des modèles, et de construction et de validation de modèles. Pour finir, les méthodes d'évaluation et d'optimisation des protocoles qui s'appuient sur ces modèles sont présentées, et l'ensemble de ces outils ainsi que leur extension sont discutés. Tout au long de cet article, nous illustrons nos propos par une application à la PK/PD de la warfarine.

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DOI (Digital Object Identifier)

https://doi.org/10.51257/a-v1-pha1010


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4. Construction et évaluation de modèles

La construction d'un modèle dans une analyse de pharmacométrie nécessite d'évaluer les modèles proposés, et de les comparer statistiquement. Nous présentons dans cette section les outils d'inférence et de diagnostics permettant de conduire ce processus décisionnel .

4.1 Inférence

  • Inférence en maximum de vraisemblance

    En régression, les tests d'inférence classiques sont le test du rapport de vraisemblance (LRT), le test de Wald et le test du score. Dans les MNLEM, le LRT, le test de Wald et les critères statistiques comme le critère d'Akaike sont le plus souvent utilisés.

    Le LRT compare les log-vraisemblances LLc et LLr de 2 modèles, Mc (complet) et Mr (réduit), présentant la particularité d'être emboîtés, c'est-à-dire que le modèle Mc , à qc = qr + qc–r paramètres, peut être réduit au modèle Mr en supposant que certains paramètres (ici qc–r ) sont nuls. L'hypothèse H 0 , soit {Mc = Mr } ou encore { θ q r+1  = … =  θ q c  = 0}, peut être testée asymptotiquement en comparant la différence entre les vraisemblances à un χ 2 de nombre de degrés de liberté égal à q...

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BIBLIOGRAPHIE

  • (1) - O'REILLY (R.), AGGELER (P.) -   Studies on the coumarin anticoagulant drugs. Initiation of warfarin therapy without a loading dose.  -  Circulation, 38, p. 169-177 (1968).

  • (2) - HOLFORD (N.H.) -   Clinical pharmacokinetics and pharmacodynamics of warfarin. Understanding the dose-effect relationship.  -  Clin. Pharmacokinet., 11, p. 483-504 (1963).

  • (3) - ETTE (E.), WILLIAMS (P.) -   Pharmacometrics : the science of quantitative pharmacology.  -  Wiley-Interscience, New-York, USA (2007).

  • (4) - STRYER (L.) -   Biochemistry.  -  3rd edition, NY, FREEMAN (W.H.) and Company, New York, USA (1988).

  • (5) - KUTTA (W.) -   Beitrag zur naeherungsweisen integration totaler differentialgleichungen.  -  Zeit. ang. Math. Physik, 46, p. 435-453 (1901).

  • (6) - SAVIC (R.M.), JONKER (D.M.), KERBUSCH (T.), KARLSSON (M.O.) -   Implementation...

1 Outils logiciels

R Development Core Team 2008 R : A language and environment for statistical computing, [logiciel].

Lixoft SAS 2013 Monolix, [logiciel]. Incuballiance, 86 rue de Paris, 91400 Orsay, France.

Icon Development Solutions 2009 NONMEM, [logiciel]. Icon Development Solutions, Ellicott City, MD, USA.

Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria.

PFIM group 2001 PFIM, [Fonction programmée en langage R]. Université Paris Diderot, 16 rue Henri Huchard 75018 Paris.

HAUT DE PAGE

2 Sites Internet

DDMoRe Consortium européen sur la modélisation de la maladie et du médicament http://www.ddmore.eu/

EMA Agence européenne du médicament http://www.ema.europa.eu/

FDA Agence américaine des produits alimentaires et médicamenteux http://www.fda.gov

Icon Development Solutions Logiciel NONMEM https://www.iconplc.com/innovation/nonmem/

Lixoft Logiciel Monolix ...

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