Le bon fonctionnement des piles à combustible PEMFC et SOFC, qui sont le siège de phénomènes physiques multiples et complexes, impose la maîtrise de la température. Les modélisations thermiques mises en œuvre sont de deux types, méthode nodale pour les parties solides et méthode aux différences finies pour les gaz.

Les systèmes pile à combustible du type à membrane échangeuse de protons fonctionnent avec des électrolytes solides à basse température ou à haute température. A ce jour, ces ensembles restent encore très complexes avec des paramètres de fonctionnement interagissant fortement entre eux.